Организация применяет УСН с уплатой НДС с ведением бухгалтерского учета. Организация оказывает инжиниринговые услуги резиденту Российской Федерации, является плательщиком НДС.

Ранее на каждую поступившую сумму от заказчика составлялся акт выполненных работ. Организация выставляла счет и акт выполненных работ подписывался на 590 000 росс. руб. Далее было указано, что заказчик как налоговый агент уплачивает НДС 90 000 росс. руб., и к оплате было представлено 500 000 росс. руб.. Организация проводила счет на 590 000 росс. руб. А потом 90 000 росс. руб. относила на внереализационные расходы датой когда был оплачен НДС в бюджет Российской Федерации (после получения платежки и справки из налоговых органов об уплате НДС).

Согласно последнему договору организации от заказчика поступило две суммы в разные периоды, а акт выполненных работ был подписан один. На первую часть платежа в марте был выставлен счет на 100 000 росс. руб. Заказчик оплатил сумму за вычетом НДС (82 000 росс. руб.). Эта сумма числится как предоплата, т.к. акт выполненных работ был подписан в апреле и вторая сумма по акту выполненных была произведена в апреле.